Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP6P35125 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP6P35125 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP6P35125 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP6P35125 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP6P35125 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms