Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPS1P31327 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPS1P31327 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CPS1P31327 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CPS1P31327 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPS1P31327 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPS1P31327 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPS1P31327 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms