Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ITGA3P26006 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms