Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCMT1P22061 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms