Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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HOXA5P20719 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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HOXA5P20719 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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HOXA5P20719 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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