Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGCP20142 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGCP20142 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGCP20142 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms