Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CREB1P16220 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms