Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRG2P13727 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRG2P13727 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms