Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA4P13612 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms