Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BMP3P12645 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BMP3P12645 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BMP3P12645 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BMP3P12645 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BMP3P12645 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BMP3P12645 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BMP3P12645 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BMP3P12645 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BMP3P12645 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms