Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGAMP11215 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGAMP11215 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms