Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HLA-DQB1P01920 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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