Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNSO60931 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms