Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPLO60437 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPLO60437 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPLO60437 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPLO60437 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPLO60437 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms