Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMC8O43402 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMC8O43402 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMC8O43402 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMC8O43402 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMC8O43402 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMC8O43402 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms