Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APAF1O14727 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APAF1O14727 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APAF1O14727 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APAF1O14727 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
APAF1O14727 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APAF1O14727 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms