Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTDSP2O14595 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTDSP2O14595 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTDSP2O14595 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTDSP2O14595 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CTDSP2O14595 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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