Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GABRPO00591 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms