Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms