Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H7C1D1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H7C1D1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H7C1D1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms