Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms