Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
B4DGG1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
B4DGG1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
B4DGG1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
B4DGG1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms