Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GJE1A6NN92 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms