Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC78A2IDD5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC78A2IDD5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms