Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPH3AQ9Y2J0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms