Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP1Q9UPQ3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AGAP1Q9UPQ3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms