Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF8Q9UPP1 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms