Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF2IRD1Q9UHL9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms