Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL28Q9NXS3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms