Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PARVAQ9NVD7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PARVAQ9NVD7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms