Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4GALTQ9NPC4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms