Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms