Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C11orf49Q9H6J7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms