Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRDM12Q9H4Q4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRDM12Q9H4Q4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms