Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM31Q9BZY9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM31Q9BZY9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms