Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHMP4AQ9BY43 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms