Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC11Q9BVV2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms