Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NDUFAF3Q9BU61 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NDUFAF3Q9BU61 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NDUFAF3Q9BU61 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NDUFAF3Q9BU61 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms