Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM175Q9BSA9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM175Q9BSA9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.9 ms