Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PITX2Q99697 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PITX2Q99697 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms