Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF13CQ96RJ3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms