Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms