Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms