Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C9orf72Q96LT7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C9orf72Q96LT7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms