Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCMH1Q96GD3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCMH1Q96GD3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms