Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CAVIN3Q969G5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms