Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCAMP4Q969E2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms