Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZNF439Q8NDP4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZNF439Q8NDP4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZNF439Q8NDP4 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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