Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HJURPQ8NCD3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms