Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN22Q8N7P3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms